Pewien ksiądz ma swoje tajemnice. Używa kościoła jako przykrywki do przemytu narkotyków. Ma jeszcze jedną – jest cyborgiem. Co prawda nie za długo, po chwili rozmowy zostaje zlikwidowany przez Alex (Sue Price) – przeniosła się ona z Afryki i przeszłości. Udaje jej się opuścić kościół, ale chwilę później rusza za nią pościg, który dość szybko ją odnajduje. Równie szybko zostaje zlikwidowany, przez z nie wiadomo jakiego powodu, półgołą Alex.

Alex Sinclair (Sue Price) jest jedyną nadzieją ludzkości. Te w 2077 podbiły i przejęły władzę nad Ziemią. Mama Alex aby uchronić ją od cyborgów cofnęła się w czasie do 1980 roku, do Afryki. Kiedy niemowlę wyrosło na młodą kobietę, na jej trop wpadł Nebula. Super cyborg z przyszłości. Walka z wojowniczą kobietą źle skończyła się dla cyborga, teraz to kupa złomu. Oczywiście to nie koniec problemów Alex.

Wojna między ludźmi i cyborgami rozpoczęła się w 2027, dziesięć lat później zakończyła się zwycięstwem cyborgów. Przegrani, ludzkość, stała się niewolnikami maszyn. Zwyczajowo jest jednak ruch oporu, walczący cały czas z oprawcami. Naukowcy z ruchu oporu stworzyli specjalny kod DNA, umożliwiające stworzenie człowieka o nadzwyczajnej sile i potędze. Jako matkę wybrano kobietę o imieniu Zana.

Ludzkość ma przerąbane. Kompletnie. Znowu. Zawsze coś jej zagraża, kosmici, asteroidy, wirusy, wojny… Długo by wymieniać. Tym razem jest to bunt maszyn. Los Angeles w 2029 roku (czyli już za 5 lat), podobnie jak cała Ziemia będzie stosem ruin. Jest to pokłosie wojny atomowej. Ruiny nie są jednak całkowicie wyludnione. Część ocalałych walczy o… ocalenie. Tym razem z rąk(?) maszyn. Zbuntowane maszyny eksterminują resztki ludzkości. Jak w większości wojen, musi odbyć się decydująca bitwa, ale, co ciekawe, nie odbędzie się ona teraz, tylko w… przeszłości.

Major Motoko Kusanagi (Atsuko Tanaka) służy w Sekcji 9 , tajnej organizacji walczącej z przestępczością komputerową. Czasami wchodzą w kompetencje innych sekcji, nie zawsze o tym je powiadamiając. Wykonują raczej brudną robotę. Czasami jednak nie da rady inaczej. Ich metody nie zawsze są policyjne, są raczej bardzo od nich odległe… Doskonale to pokazuje uniemożliwienie wyjazdu, a raczej ucieczki z kraju, pewnego programisty. Zdradził on i dostał azyl i jest „nietykalny”. Jednak nie dla Sekcji 9.

Detroit to niebezpieczne miasto, przestępczość jest tu bardzo duża. Najbardziej wyróżnia się tu Stare Detroit – to prawdziwe siedliszcze przestępczości. Policja, pomimo swojej bardzo ciężkiej i ofiarnej pracy, nie potrafi zapanować nad sytuacją. Wielu policjantów zginęło na służbie. Sytuacji nie poprawia fakt… sprzedaży policji przez miasto firmie OCP – Only Consumers Products. Teraz to oni będą zarządzać bezpieczeństwem społeczności Detroit.